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直属中国农业科学院领导。现有6个职能部门、4个研究中心、2个支撑部门、1个所办企业。 - 新闻中心
及时发布研究所发展重大事件、科研动态、国际国内合作动态、农业环保成果推广动态等，保障农业环保科研和成果最新动态呈现。 - 科学研究
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目前共有博士生导师14名，硕士生导师49名，在所研究生约160人（含留学生）。 - 创新平台
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提升管理效能，院所打造涵盖OA、邮件、科研管理、物资采购、文献检索、视频会议等智能办公系统。
